Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXA10P31260 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms