Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms