Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM2AQ9Y2K7 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms