Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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