Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCM2LQ9NUG4 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCM2LQ9NUG4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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