Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ube3bQ9ES34 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ube3bQ9ES34 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ube3bQ9ES34 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ube3bQ9ES34 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ube3bQ9ES34 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ube3bQ9ES34 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ube3bQ9ES34 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ube3bQ9ES34 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ube3bQ9ES34 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ube3bQ9ES34 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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