Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup155Q99P88 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms