Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms