Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC93Q567U6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC93Q567U6 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms