Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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CUL4AQ13619 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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CUL4AQ13619 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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CUL4AQ13619 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CUL4AQ13619 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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