Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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