Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGAEP38570 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms