Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Diexf-201ENSMUST00000085555 5570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Ctnnd1-210ENSMUST00000111684 6021 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Olfr981-202ENSMUST00000215956 8197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Pzp-201ENSMUST00000112132 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 2310057M21Rik-201ENSMUST00000059438 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 4933407K13Rik-203ENSMUST00000138943 4364 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Dnm3-201ENSMUST00000070330 4601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gm21969-201ENSMUST00000178644 4402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Kansl1-203ENSMUST00000106971 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 AC153940.1-201ENSMUST00000220149 5300 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Synrg-202ENSMUST00000092834 7115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Med12-204ENSMUST00000117706 6940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SptssbQ925E8 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms