Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC173Q0VFZ6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms