Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACTN1P12814 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACTN1P12814 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms