Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC115618.3-201ENST00000623114 425 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CACNA1GO43497 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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