Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casq1O09165 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casq1O09165 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casq1O09165 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms