Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E9PCH4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PCH4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PCH4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PCH4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PCH4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PCH4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PCH4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PCH4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PCH4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PCH4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PCH4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PCH4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PCH4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PCH4 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PCH4 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PCH4 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PCH4 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PCH4 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PCH4 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PCH4 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PCH4 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PCH4 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PCH4 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PCH4 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PCH4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PCH4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PCH4 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PCH4 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PCH4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E9PCH4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PCH4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PCH4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PCH4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PCH4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PCH4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PCH4 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PCH4 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PCH4 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PCH4 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PCH4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PCH4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PCH4 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PCH4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PCH4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PCH4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PCH4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PCH4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E9PCH4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
E9PCH4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
E9PCH4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
E9PCH4 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
E9PCH4 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
E9PCH4 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
E9PCH4 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
E9PCH4 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
E9PCH4 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
E9PCH4 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
E9PCH4 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
E9PCH4 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
E9PCH4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
E9PCH4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E9PCH4 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E9PCH4 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E9PCH4 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E9PCH4 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms