Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TTC29Q8NA56 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TTC29Q8NA56 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms