Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms