Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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