Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp4P35123 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp4P35123 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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