Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XIRP2A4UGR9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms