Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rad18Q9QXK2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.3 ms