Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLMPQ9H6B4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms