Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

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Length 1,298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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AMBRA1Q9C0C7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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AMBRA1Q9C0C7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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AMBRA1Q9C0C7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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AMBRA1Q9C0C7 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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AMBRA1Q9C0C7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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AMBRA1Q9C0C7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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AMBRA1Q9C0C7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AMBRA1Q9C0C7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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