Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms