Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trip10Q8CJ53 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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