Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Snx8Q8CFD4 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx8Q8CFD4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx8Q8CFD4 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx8Q8CFD4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx8Q8CFD4 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx8Q8CFD4 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Snx8Q8CFD4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms