Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL40Q2TBA0 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms