Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IHHQ14623 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IHHQ14623 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IHHQ14623 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IHHQ14623 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IHHQ14623 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IHHQ14623 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IHHQ14623 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms