Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms