Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME5P56597 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME5P56597 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms