Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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RABGEF1Q9UJ41 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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RABGEF1Q9UJ41 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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RABGEF1Q9UJ41 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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RABGEF1Q9UJ41 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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RABGEF1Q9UJ41 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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RABGEF1Q9UJ41 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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RABGEF1Q9UJ41 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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RABGEF1Q9UJ41 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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