Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMG20BQ9P0W2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HMG20BQ9P0W2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms