Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms