Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp1aQ2LKU9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms