Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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ZNF239Q16600 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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ZNF239Q16600 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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