Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLN3Q13286 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLN3Q13286 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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