Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXO1Q12778 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FOXO1Q12778 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FOXO1Q12778 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FOXO1Q12778 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FOXO1Q12778 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXO1Q12778 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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