Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
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