Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHA3P29320 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms