Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA1P20827 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA1P20827 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFNA1P20827 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.05■□□□□ 0
EFNA1P20827 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EFNA1P20827 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFNA1P20827 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFNA1P20827 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFNA1P20827 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFNA1P20827 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFNA1P20827 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EFNA1P20827 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFNA1P20827 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms