Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNNI3P19429 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms