Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb7P09024 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms