Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPLO60437 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPLO60437 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPLO60437 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPLO60437 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PPLO60437 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPLO60437 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPLO60437 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPLO60437 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPLO60437 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPLO60437 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPLO60437 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPLO60437 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPLO60437 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPLO60437 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPLO60437 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPLO60437 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPLO60437 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPLO60437 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPLO60437 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPLO60437 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPLO60437 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPLO60437 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPLO60437 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPLO60437 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPLO60437 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPLO60437 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPLO60437 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PPLO60437 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms