Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID3CA6NKF2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms