Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm5114W4VSN8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm5114W4VSN8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5114W4VSN8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5114W4VSN8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5114W4VSN8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm5114W4VSN8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm5114W4VSN8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm5114W4VSN8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm5114W4VSN8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm5114W4VSN8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm5114W4VSN8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm5114W4VSN8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm5114W4VSN8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm5114W4VSN8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm5114W4VSN8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm5114W4VSN8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm5114W4VSN8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm5114W4VSN8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm5114W4VSN8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm5114W4VSN8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm5114W4VSN8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm5114W4VSN8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms