Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC36.34■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
MAP3K4Q9Y6R4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
MAP3K4Q9Y6R4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
MAP3K4Q9Y6R4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
MAP3K4Q9Y6R4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
MAP3K4Q9Y6R4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
MAP3K4Q9Y6R4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
MAP3K4Q9Y6R4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
MAP3K4Q9Y6R4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
MAP3K4Q9Y6R4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
MAP3K4Q9Y6R4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
MAP3K4Q9Y6R4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
MAP3K4Q9Y6R4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
MAP3K4Q9Y6R4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC36.3■■■■□ 3.4
MAP3K4Q9Y6R4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
MAP3K4Q9Y6R4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
MAP3K4Q9Y6R4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
MAP3K4Q9Y6R4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
MAP3K4Q9Y6R4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
MAP3K4Q9Y6R4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
MAP3K4Q9Y6R4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
MAP3K4Q9Y6R4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
MAP3K4Q9Y6R4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.4
MAP3K4Q9Y6R4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
MAP3K4Q9Y6R4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC36.25■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms