Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Psmb3Q9R1P1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb3Q9R1P1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb3Q9R1P1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms